此前，來自患者的樣本被送往各州和聯(lián)邦實驗室，然后由疾病診斷專家查看這些傳染是否由同一種細菌導致。在進行足量對比分析之后，傳染病學家開始詢問患者，尋找導致該疾病的同一種食物來源。

但這樣的測試并不能一錘定音，而把一個傳染案例和另一個案例聯(lián)系在一起又要花費額外的時間。“當這一切在進行時，很多被污染的農(nóng)產(chǎn)品已經(jīng)接觸到公眾。”美國食品藥品監(jiān)督管理局（FDA）食品安全與應用營養(yǎng)科學實踐辦公室副主任Steven Musser說。

現(xiàn)在，F(xiàn)DA正在構建一個聯(lián)邦州及聯(lián)邦實驗室網(wǎng)絡，以幫助繪制李斯特菌、沙門氏菌和其他食源性病原體的準確DNA。這些測出來的序列會被上傳到位于國立衛(wèi)生研究院的公共數(shù)據(jù)庫中。該技術不僅可以把一種病原體和其他多種類似菌種區(qū)分開，還可以表明同一個菌株發(fā)生的細微異變。

與此同時，F(xiàn)DA已經(jīng)開始對日常植物檢查中發(fā)現(xiàn)的病原體進行測序，并把結果加入該數(shù)據(jù)庫。該機構表示，這種做法的一大優(yōu)點是可以迅速把病人和一次疫病聯(lián)系在一起。另一個優(yōu)勢是，在一些患者生病后，可以辨別發(fā)病源，縮短常規(guī)檢查所需的時間，減少了被感染農(nóng)產(chǎn)品走上貨架帶來的大面積傳播的風險。